学制不同：
自考没有学制限制，比较灵活，考完就能申请毕业拿证。而函授本科有固定学制，高起本是5年，高起专/专升本是2.5年。
学习方式不同：
自考以考生自学为主，考生可选择自学或报班。而函授主要以有计划、有组织、有指导的自学为主，并组织系统的集中面授，面授时间一般为周末或者晚上。
毕业证不同：
自考毕业证上面加盖省自考委印章和主考院校印章（双章），函授本科毕业证书上面只加盖毕业学校的章（单章）。虽然证书不同，但两者都是国家承认，学信网可查的文凭，同学们可放心报考。
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